De Marco Vita Lucia

Riassunto in italiano
I norovirus (NoV) sono riconosciuti come uno dei principali agenti enteropatogeni umani, trasmissibili tramite consumo di alimenti o acqua contaminata e tramite contatto diretto o indiretto. Essi rappresentano una causa frequente di gastroenterite acuta nell'uomo in tutte le fasce di età, in particolare in soggetti di età pediatrica. Tuttavia, solo lo 0.2- 0.3% delle infezioni da NoV comporta solitamente l'ospedalizzazione dei soggetti colpiti. L'analisi di campioni provenienti da tali soggetti è un ottimo sistema per generare dati epidemiologici a livello di popolazione. Nella presente tesi sono stati testati 51 campioni fecali di bambini ospedalizzati con gastroenterite da NoV, prelevati nell'anno 2015 sul territorio di Bari. Mediante tipizzazione con sistemi diagnostici standard disegnati sulle regioni B (polimerasi) e C (capside) è stato possibile confermare la presenza di NoV nel 92.1% (47/51) dei campioni testati e tipizzare correttamente mediante sequenziamento diretto un totale di 29/51 (56.8%) dei ceppi nella regione C e 41/51 (80.4%) nella regione B. Questa analisi ha rivelato la circolazione sul territorio di diversi ceppi, tra cui il ceppo GII.17 Kawasaki 2014, emerso negli ultimi anni come un ceppo epidemico maggiore nel sud-est asiatico.
Abstract in inglese
Noroviruses are recognized as major human enteric pathogens transmitted to human through consumption of contaminated food or water or through either direct or indirect contact. They represent a frequent cause of acute gastroenteritis in humans in all ages, chiefly in pediatric population. However, only 0.2- 0.3% of infections caused by NoV usually require hospitalization of affected individuals. The analysis of samples from such patients is an excellent system to generate epidemiological data at the population level. In this thesis we tested 51 fecal samples from children hospitalized with gastroenteritis caused by NoV, collected during 2015 in Bari. By typing with standard diagnostic system designed on the B (polymerase) and C (capsid) regions it was possible to confirm the presence of NoV in 91.2% (47/51) of the samples tested. Also after direct sequencing, it was possible to characterize correctly 29/51 (56.8%) of the strains in region C and 41/51 (80.4%) in region B. This analysis revealed the local circulation of different strains, including the strain GII.17 Kawasaki 2014, emerged in recent years as a major epidemic strain in the South-East of the Asiatic continent.