Pubblicazione paper su Springer Nature
"Machine learning-based assessment of the healthy human gut mycobiota landscape using ITS1 DNA metabarcoding data" Dott. Giuseppe Defazio e colleghi, sotto la supervisione dei prof. Bruno Fosso e Graziano Pesole
Siamo lieti di condividere il lavoro intitolato "Machine learning-based assessment of the healthy human gut mycobiota landscape using ITS1 DNA metabarcoding data". In questo lavoro il Dott. Giuseppe Defazio, ricercatore del nostro dipartimento, e colleghi hanno analizzato dati pubblici da 1.500 campioni fecali per investigare la composizione della componente fungina del microbioma intestinale umano ovvero la frazione meno rappresentata e meno investigata. Lo sforzo di individuare una profilo composizionale salutare corrispondente all'eubiosi non è nuovo. In questo lavoro, per superare i fattori confondenti abbiamo usato approcci di Machine Learning (Random Forest), raggiungendo una accuratezza superiore all'80% nel classificare soggetti sani da soggetti malati. In particolare, sono stati identificati generi mai associati prima alla condizione di eubiosi come Eurotium. Questo lavoro è stato finanziato dal progetto PNC PNRR DARE sotto la supervisione dei Prof. Bruno Fosso e Graziano Pesole.